珠海港位于廣東省南部、珠江入海口西岸及萬山群島內，東距維多利亞港73海里，北距廣州港黃埔港區107海里。該港是珠江三角洲四部自然條件優良的港口，為貨物中轉、貯存，加工服務的主要樞組港之一。

珠海港作業區點多面廣，分布于珠海市東部和西部地區，東部有萬山港區、唐家港區、香洲港區、九洲港區，西部有高欄港區、洪灣港區和斗港區，共計7個港區。

萬山港區位于柱山島、中心洲、牛頭島的兩岸及萬山列島附近，規劃有桂山、萬山和外伶們三個作業區，目前以桂山作業區為主。桂山作業區位于桂山島、中心洲、牛頭島的兩岸，桂山島、中心洲、牛頭島已連成一體，港區已修筑1號、2號防波堤，分為一灣和二灣作業區，原有的漁碼頭已回填成陸地，成為小噸位的雜貨和客運碼頭。桂山作業區為國家一類開放口岸，中燃阿基普供油基地已建成5萬噸級多點系泊泊位1個和5000噸級油船泊位2個，后方罐區庫容可達9．8萬立方米，主要為珠江三角洲地區、廣州、深圳、珠海等地提供煤油的倉儲中轉服務。

唐家港區位于珠江口西岸唐家灣北側，主要港區位于金星門水道南側，北側有淇澳島，以件雜、油氣品運輸為主。

香洲港區位于珠海市東部香洲灣內，陸域沿北堤以南布置，是商、漁混合港口，已劃分為南端漁船停泊區和北端客貨運區，目前主要承擔陸島交通和少量集裝箱運輸。

九洲港區位于珠海市中心城區東端，珠海市東南端的炮臺山南側，東與深圳港西部港區隔珠江口相望，西南與澳門港毗鄰，建有多個多用途、客運、滾裝泊位。

高欄港區位于珠海市西部，黃茅海東岸，為珠海港主港區。其陸域范圍北起虎跳門口門南岸，南至高欄島最南端，包括三角山島、大島、荷包島等島嶼。港區規劃有南逕灣、南水、黃茅海、荷苞島、雞啼門等作業區組成。目前運營的有南徑灣、南水兩個作業區，吞吐貨種以石油化工品、煤炭、礦石等大宗干散貨、通用雜貨和集裝箱為主。南逕灣作業區由南逕灣和鐵爐灣兩部分組成，自新海能源（原巖谷）液化氣碼頭至牛龍咀岸線規劃為以液體散貨中轉為主的專業化港區，以危險品、油品、液體化工儲存、分銷、中轉為主。已建成1400米防波堤，防波堤以北的南逕灣內共形成三個垂直岸線的棧橋碼頭，北部平排山以南回填區形成順岸三個泊位，加之防波堤內側的液體散貨泊位，共形成37個泊位，其中一突堤7個泊位，二突堤6個泊位，三突堤6個泊位。平排山以北碼頭由引橋與陸域相接，建有大型碼頭3個。鐵爐灣為南逕灣作業區的遠景發展預留作業區。

洪灣港區包括洪灣沖作業區、保稅區作業區和灣仔作業區。洪灣沖作業區位于馬騮洲水道上游的洪灣涌水閘的下游，前山港區貨運碼頭遷至該作業區，該作業區主要承擔南灣城區、橫琴新城等的建筑材料和物資運輸服務，遠期將發展內河集裝箱運輸業務。保稅區作業區位于珠海保稅區內，橫琴大橋上游1280米處，作業區前方面臨馬騮洲水道，水域比較寬闊，后方陸域平坦，已人工填土整平。作業區依托條件良好，主要為珠海保稅區及附近的工業園區服務，以集裝箱運輸為主。灣仔作業區位于珠海市區南部，馬騮洲水道東端北側，前山水道南側，與澳門一水之隔，港口東邊是澳門，港池長約3千米，寬約500米，是天然的小型船舶避風錨地。