防城港域位于廣西壯族自治區南部沿海，北部灣北岸西部，東鄰欽州港域。原防城港是該港域的主體，東距北海港域石步嶺港區55海里，東南距海口港秀英港區157海里，西南距越南海防港151海里。該港港口朝南，背靠大陸丘陵，航道水深、短且不淤積，助航設備完善，錨地寬闊，防風條件較好，碼頭分布于漁瀝島東、西兩側的東灣和西灣內，裝卸設備齊全，是我國大陸海岸線最西南的一個深水良港和大西南最便捷的出海通道，為我國類對外開放口岸、全國主樞紐港之一。

防城港包括漁瀝港區、企沙港區、企沙東港區和茅嶺、榕木江、白龍、潭吉、京島、竹山、大小冬瓜等港點，其中漁瀝港區為大型綜合性港區，企沙港區和企沙東港區為大型臨港工業服務港區。

漁瀝港區分7個作業區，分別為第一作業區至第六作業區以及馬荍嶺作業區：

第一作業區已建成，包括現有的村料碼頭、0號－8號泊位和中級泊位等貨運泊位，以及工作船碼頭和海關碼頭。作業區主要承擔件雜貨、散裝水泥、散糧等貨物的中轉儲運。作業區岸線長3164米，其中深水岸線1645米、500噸～30000噸級生產性泊位19個，其中萬噸級以上泊位9個，另有非生產性泊位7個，岸線長585米，年通過能力730萬噸。

第二作業區位于第一作業區以南，由9號－17號泊位組成。作業區主要承擔干散貨和集裝箱的中轉運輸，其中9號和10號泊位發展集裝箱運輸，11號－17號泊位發展干散貨運輸。作業區岸線總長2424米，有9個2．5萬～7萬噸級泊位，年通過能力1040萬噸，集裝箱通過能力50萬標準箱。

第三作業區位于第二作業區南側，由18號－22號泊位組成，主要承擔大宗干散貨、兼顧件雜貨的運輸。規劃岸線總長1566米，布置5個7萬～10萬噸級通用泊位，年通過能力4230萬噸。

第四作業區位于第三作業區東側、暗埠江深槽西側、現有20萬噸級碼頭向北至5萬噸級化工碼頭南部，包括現有的20萬噸級碼頭和403號－407號泊位。主要承擔大宗干散貨和集裝箱運輸。作業區規劃岸線3856米，自南向北布置20萬噸級碼頭和401號－410號泊位，其中20萬噸級碼頭和401號、402號泊位為20萬噸級散貨泊位，其余泊位為5萬噸～7萬噸級多用途泊位，年通過能力約4000萬噸。

第五作業區位于第四作業區北側、5萬噸級化工碼頭向北至漁洲坪南約1．5千米處，規劃發展液體散貨、件雜貨和集裝箱運輸。規劃岸線5982米，自南向北布置5萬噸級化工碼頭和501號－516號泊位，其中5萬噸級化工碼頭和501號－510號泊位為5萬噸級液體散貨泊位，511號－516號泊位為3萬噸級件雜貨泊位和多用途泊位，年通過能力約4000萬噸。

第六作業區由第三作業區22號泊位和第四作業區20萬噸級碼頭的南端沿深槽向南延伸，通過填海造地和西賢航道改道而成，規劃發展干散貨運輸。規劃岸線6576米，西側規劃岸線3726米，自北向南布置601號－612號等12個10萬噸～15萬噸級散貨泊位；東側規劃岸線2850米，自北向南布置613號－620號等8個20萬噸級散貨泊位，年通過能力約10000噸。

馬鞍嶺作業區位于西灣西岸、石坪至牛頭嶺之間，規劃發展旅游客運及建設港口支持保障系統。作業區規劃岸線長2195米，布置5個7500噸～10萬噸級泊位，年通過能力約30萬噸、200萬人次

企沙港區位于防城港東南方24千米處，歸防城港市港口區管轄，是北部灣著名的漁貨集散地、廣西第二大漁港、國家邊地貿口岸、漁商共用港，企沙港區自北向南由潭油作業區、云約江作業區、赤沙作業區和企沙南作業區組成。港區規劃岸線55921米，其中深水岸線49235米；規劃布置219個1000噸～40萬噸級泊位，其中深水泊位179個；年通過能力72550萬噸。

企沙港區海域水深浪靜，是建設大型深水碼頭的理想港灣，現有1000噸～1500噸級泊位12個。在目前的規劃當中，企沙半島西側將建設26個1萬～20萬噸級泊位的臨港工業區業主碼頭，而在南面的蝴蝶嶺外海處，將建設3個～5個30萬噸級泊位。

企沙東港區規劃布置能源、化工泊位區LNG泊位區、散貨泊位區、通用泊位區、海洋裝備制造和修造船基地、港口輔助配套區和預留發展區以及綜合物流區等功能區。

2014年，防城港完成貨物吞吐量1．1億噸。其中外貿貨物8896萬噸，出港貨物2877萬噸，集裝箱完成32萬標箱。全年完成水運建設投資約10．6億元。